Communications des 5 dernières années
Vous trouverez ici la liste des communications de l'équipe sur les 5 dernières années, pour avoir l'ensemble des données vous pouvez consulter la page des productions.
CONFÉRENCES INVITÉES DANS UN CONGRÈS INTERNATIONAL
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Bonnet, P. ; Bournez, C. ; Peyrat, G. ; Krezel, P. ; Aci-Sèche, S.
An In silico Fragment Based Design Tool for the Discovery of NovelKinase Inhibitors
21st Romanian International Conference on Chemistry and Chemical Engineering (RICCCE 2019)
sept. 2019 - Constanta (Roumanie).
CONFÉRENCES INVITÉES DANS UN CONGRÈS NATIONAL
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Pescheteau, C. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
Design and synthesis of original imidazothiadiazoles as dual DYRK1A/CLK1 inhibitors
Semaine d'Études en Chimie Organique - SECO 58
sept. 2021 - Bussang.
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Bonnet, P.
AI in Medicinal Chemistry
33ème Journée du projet CASCIMODOT
déc. 2020 - e-conference.
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Bonnet, P.
Application of ligand- and fragment-based design tools for the discovery of novel kinase inhibitors
Les "Lundis de l’IPSIT"
janv. 2020 - Châtenay-Malabry.
COMMUNICATIONS ORALES DANS UN CONGRÈS INTERNATIONAL
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
A novel protocol for protein-ligand binding affinity prediction via spatio-temporal deep learning and molecular dynamics simulations
XXIII congrès du Group of Graphism and Molecular Modeling (GGMM)
mai 2023 - Toulouse.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
The use of deep neural networks on molecular dynamics simulations for the prediction of binding affinities
RSC- Analyst prize
23rd European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship (EuroQSAR)
sept. 2022 - Heidelberg (Allemagne).
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Berabez, R. ; Champiré, A. ; Sainjon, M. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Mathea, S. ; Knapp, S. ; Cosson, A. ; Corret, J. ; Girardin, C. ; Ruchaud, S. ; Vallée, B. ; Brion, R. ; Verrecchia, F. ; Plé, K. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
Synthesis and preclinical validation of LIMKs inhibitors: Promising drugs for osteosarcoma treatment?
29th Young Research Fellow Meeting
juil. 2022 - Nantes.
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Pescheteau, C. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
Design and synthesis of dual inhibitors of DYRK1A/CLK1 kinases involved in neurodegenerative diseases
8th EFCM-YMCS Young Medicinal Chemists' Symposium
sept. 2021 - e-conference.
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Pescheteau, C. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
Design and synthesis of dual inhibitors of DYRK1A/CLK1 kinases involved in neurodegenerative diseases
Premier prix de communication orale
28th Young Research Fellow Meeting
févr. 2021 - Paris.
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Buron, F. ; Place, M. ; Copin, C. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Routier, S.
Efficient functionalization of Imidazo[2,1-b][1,3,4]thiadiazoles, access to new kinases inhibitors
21st Romanian International Conference on Chemistry and Chemical Engineering (RICCE21)
sept. 2019 - Constanta (Roumanie).
COMMUNICATIONS ORALES DANS UN CONGRÈS NATIONAL
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Mao, X. ; Ansar, S. ; Velusamy, M. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
Universal Frags2Drugs (uF2D): a proteome-wide in silico fragment-based ligand design tool
11èmes Journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCI
oct. 2023 - Caen.
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Mao, X. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
Universal Frags2Drugs (uF2D): a proteome-wide in silico fragment-based ligand design tool
Journées de la Section Régionale Centre Ouest de la SCF
juin 2023 - Orléans.
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Plé, K. ; Vallée, B. ; Berabez, R. ; Champiré, A. ; Sainjon, M. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Mathea, S. ; Knapp, S. ; Cosson, A. ; Corret, J. ; Girardin, C. ; Josselin, B. ; Ruchaud, S. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
Les LIM kinases, des cibles thérapeutiques prometteuses pour le traitement du glioblastome : de la conception de petites molécules inhibitrices aux tests cellulo
Cancéropôle Grand Ouest, colloque du réseau Molécules marines, métabolisme et cancer
mai 2023 - Mansigné.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Predicting protein-ligand binding affinity by applying spatio-temporal deep learning on molecular dynamics simulations
Journée thématique « Deep Learning, théorie et application » RTR DIAMS
mars 2023 - Tours.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Spatio-temporal deep learning combined with molecular dynamics simulations to predict protein-ligand binding affinity
Journée thématique « Human in the loop for data mining and machine learning » RTR DIAMS
janv. 2023 - Orléans.
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Plé, K. ; Vallée, B. ; Berabez, R. ; Champiré, A. ; Sainjon, M. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Mathea, S. ; Knapp, S. ; Cosson, A. ; Corret, J. ; Girardin, C. ; Josselin, B. ; Ruchaud, S. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
Les LIM kinases, des cibles thérapeutiques prometteuses pour le traitement du glioblastome : de la conception de petites molécules inhibitrices aux tests cellulo
Cancéropôle Grand Ouest, journée scientifique du réseau Cancers des Tissus Hormono-dépendants (CASTHOR)
déc. 2022 - Nantes.
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Plé, K. ; Verrecchia, F. ; Vallée, B. ; Brion, R. ; Berabez, R. ; Champiré, A. ; Sainjon, M. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Mathea, S. ; Knapp, S. ; Cosson, A. ; Corret, J. ; Girardin, C. ; Josselin, B. ; Ruchaud, S. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
Un nouvel inhibiteur des LIMKs, l'AC429, bloque la croissance des tumeurs primaires d'ostéosarcome
Cancéropôle Grand Ouest, colloque du réseau Molécules marines, métabolisme et cancer
mai 2022 - Mansigné.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Protein-Ligand binding affinity prediction by combining molecular dynamics simulations with deep learning approaches
3ème journée des doctorants MIPTIS / RTR DIAMS
avril 2022 - Tours.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Protein-Ligand binding affinity prediction using combined molecular dynamics and deep learning approaches
journées calcul et données - JCAD
déc. 2021 - Dijon.
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Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
Application of Frags2Drugs for the fragment-based drug design of macrocyclic kinase inhibitors
XXII congrès du GGMM (Group of Graphism and Molecular Modeling) & 10èmes journées de la SFCi (French Society of Chemoinformatics )
oct. 2021 - Lille.
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Bourzikat, O. ; Faarasse, S. ; El Kazzouli, S. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Suzenet, F. ; Guillaumet, G.
Palladium-catalyzed regioselective C-H arylation of 4-azaindazole at C3, C5 and C7 Positions
Semaine d'Études en Chimie Organique - SECO 58
sept. 2021 - Bussang.
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Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
Discovery of macrocyclic inhibitors of ALK using Frags2Drugs, a fragment-based drug design in silico tool
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM
juil. 2021 - Paris.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Prediction of binding affinity of protein-ligand complexes combining molecular dynamics simulations with deep learning algorithms
3èmes édition des journées jeunes chercheurs - J2C-2021
mars 2021 - Orléans.
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Bourg, S. ; Bonnet, P.
Chemoinformatic Python tools used in French academic laboratories
9èmes Journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCI-2019
nov. 2019 - Paris.
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Bournez, C. ; Peyrat, G. ; Gally, J.-M. ; Krezel, P. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
Fragment linking combined to graph-based approach in the discovery of novel kinase inhibitors
9èmes Journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCI-2019
nov. 2019 - Paris.
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Aci-Sèche, S.
In silico developments for kinase drug discovery
30ème Journée du projet CASCIMODOT
juil. 2019 - Tours.
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Aci-Sèche, S. ; Braka, A. ; Ziada, S. ; Bourg, S. ; Rimbaud, E. ; Ducrot, P. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
In silico prediction of residence time for protein kinase inhibitors
21ème congrès du Groupe de Graphisme et Modélisation Moléculaire (GGMM)
avril 2019 - Nice.
COMMUNICATIONS PAR POSTER DANS UN CONGRÈS INTERNATIONAL
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Krezel, P. ; Bourg, S. ; Buron, F. ; Routier, S. ; Roche, P. ; Betzi, S. ; Morelli, X. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
Targeting the proteome using an innovative in silico fragment-based ligand design tool
57th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT)
juil. 2023 - Lille.
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Molineau, J. ; Bourg, S. ; Boisseau, N. ; Hideux, M. ; Hennig, P. ; Bertin, S. ; Mauge, F. ; Bonnet, P. ; West, C.
Chromatographic retention prediction in RPLC by machine learning
HPLC 2023
juin 2023 - Düsseldorf (Germany).
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Berabez, R. ; Champiré, A. ; Sainjon, M. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Mathea, S. ; Knapp, S. ; Cosson, A. ; Corret, J. ; Girardin, C. ; Ruchaud, S. ; Vallée, B. ; Brion, R. ; Verrecchia, F. ; Plé, K. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
Synthesis and preclinical validation of LIMKs inhibitors: Promising drugs for osteosarcoma treatment?
XXVII EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry (EFMC-ISMC 2022)
sept. 2022 - Nice.
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Bourzikat, O. ; Hiebel, M.-A. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Suzenet, F. ; El Kazzouli, S. ; Bonnet, P.
Design, synthesis and biological evaluation of original compounds with isoquinolinone scaffold as BRAF protein kinase inhibitors
XXVII EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry (EFMC-ISMC 2022)
sept. 2022 - Nice.
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Pescheteau, C. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Routier, S. ; Buron, F.
Design and synthesis of dual inhibitors of dYRK1A/CLK1 kinases involved in neurodegenerative diseases
XXVII EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry (EFMC-ISMC 2022)
sept. 2022 - Nice.
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Ziada, S. ; Diharce, J. ; Raimbaud, E. ; Ducrot, P. ; Bonnet, P. ; Aci-Sèche, S.
Estimate the residence time of a drug by biased molecular dynamics simulations
23rd European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship (EuroQSAR)
sept. 2022 - Heidelberg (Allemagne).
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Learning from molecular dynamics simulations with deep neural networks for the prediction of protein-ligand binding affinity
29th Young Research Fellow Meeting
juil. 2022 - Nantes.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Development of a method combining molecular dynamics simulations and deep learning for the prediction of protein-ligand binding affinity
8th Strasbourg Summer School in Chemoinformatics (CS3-2022)
juin 2022 - Strasbourg.
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Pescheteau, C. ; Place, M. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Ruchaud, S. ; Buron, F. ; Routier, S.
Imidazo[2,1-b][1,3,4]thiadiazoles : Conception and synthesis of novel DYRK1A/CLK1 dual inhibitors
27th Young Research Fellow Meeting
janv. 2020 - Caen.
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Barrault, C. ; Aci-Sèche, S. ; Buscaglia, P. ; Dayot, S. ; Pateau, V. ; Mignen, O. ; Bonnet, P. ; Carreaux, F. ; Penna, A.
N-3,4-Dimethoxycinamoyl anthranilic acid (tranilast) validation and optimisation as pharmacological tool to target TRPV2 pro-metastatic action
30th Ion Channels Meeting
sept. 2019 - Sète.
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Peyrat, G. ; Carles, F. ; Bourg, S. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
Future perspective in data mining, data visualization and deep learning for kinase search
55èmes Rencontres Internationales de Chimie Thérapeutique (RICT 2019)
juil. 2019 - Nantes.
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Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Krezel, P. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
Design of macrocyclic kinase inhibitors from fragment
55èmes Rencontres Internationales de Chimie Thérapeutique (RICT 2019)
juil. 2019 - Nantes.
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Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Gally, J.-M. ; Krezel, P. ; Driowya, M. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P.
FRAGS2DRUGS : Using fragment network to find new kinase inhibitors
55èmes Rencontres Internationales de Chimie Thérapeutique (RICT 2019)
juil. 2019 - Nantes.
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Vallée, B. ; Cosson, A. ; Doudeau, M. ; Godin, F. ; Champiré, A. ; Lelièvre, T. ; Plé, K. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P. ; Routier, S. ; Bénédetti, H.
LIM kinases, new therapeutic targets to treat cancers, neurological disorders and Neurofibromatosis: development of small molecule inhibitors
44th FEBS Congress
juil. 2019 - Krakow (Poland).
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Bournez, C. ; Peyrat, G. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Driowya, M. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P.
Discovering new kinase inhibitors from fragment network: Frags2Drugs
7th RSC-BMCS Fragment-based Drug Discovery meeting (Fragments 2019)
mars 2019 - Cambridge (Royaume Uni).
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Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Driowya, M. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P.
Frags2Drugs: from fragment database to new potent and selective protein kinase inhibitors
26th Young Research Fellow Meeting
févr. 2019 - Paris.
COMMUNICATIONS PAR POSTER DANS UN CONGRÈS NATIONAL
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Mao, X. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
FragCon: Predicting fragment contribution to protein-ligand binding affinity
Journée Scientifique de la Fédération Physique et Chimie du Vivant- FR2708
août 2022 - Orléans.
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Pescheteau, C. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Routier, S. ; Buron, F.
Design and synthesis of dual inhibitors of DYRK1A/CLK1 kinases involved in neurodegenerative diseases
REncontres en Chimie Organique Biologique - RECOB 18
avril 2022 - Aussois.
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Place, M. ; Elie, J. ; Carles, F. ; Baratte, B. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
Design of novel imidazopyridazines as strong Haspin inhibitors
REncontres en Chimie Organique Biologique - RECOB 18
avril 2022 - Aussois.
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Aouidate, A. ; Roy, V. ; Agrofoglio, L. A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
Indentification of new small molecules antiviral agents as protein-protein inhibitors of the ACE2: Coronavirus Spike Interactions to prevent the entry of SARS-CoV-2 to the host cell
XXII congrès du GGMM (Group of Graphism and Molecular Modeling) & 10èmes journées de la SFCi (French Society of Chemoinformatics )
oct. 2021 - Lille.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Protein-Ligand binding affinity prediction using combined molecular dynamics and deep learning approaches
XXII congrès du GGMM (Group of Graphism and Molecular Modeling) & 10èmes journées de la SFCi (French Society of Chemoinformatics )
oct. 2021 - Lille.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Prediction of binding affinity of protein-ligand complexes combining molecular dynamics simulations with deep learning algorithms
Biotechnocentre
oct. 2021 - Les Hauts de Bruyères.
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Pescheteau, C. ; Ruchaud, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
Original Imidazo[2,1-b][1,3,4]thiadiazoles as kinases inhibitors
Biotechnocentre
oct. 2021 - Les Hauts de Bruyères.
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Krezel, P. ; Bonnet, P.
Identification of bioactive peptide conformations using a novel in silico approach
21ème congrès du groupe français des peptides et protéines
mai 2020 - Amboise.
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Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Gally, J.-M. ; Krezel, P. ; Driowya, M. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P.
Frags2Drugs: discovery of kinase inhibitors from a fragment network
9èmes Journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCI-2019
nov. 2019 - Paris.
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Peyrat, G. ; Carles, F. ; Bourg, S. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
Perspective in data mining, data visualization and deep learning for kinase research
Prix du meilleur poster
9èmes Journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCI-2019
nov. 2019 - Paris.
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Pescheteau, C. ; Place, M. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Ruchaud, S. ; Buron, F. ; Routier, S.
Imidazo[2,1-b][1,3,4]thiadiazoles : conception et synthèse de nouveaux inhibiteurs doubles des kinases DYRK1A/CLK1
32ème colloque Biotechnocentre
oct. 2019 - Seillac.
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Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Driowya, M. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P.
Frags2Drugs: from fragment database to new potent and selective protein kinase inhibitors
Journée Scientifique de la Fédération Physique et Chimie du Vivant- FR2708
avril 2019 - Orléans.
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Bernard, P. ; Bonnet, P. ; Daniellou, R. ; Degrange, T. ; Destandau, E. ; Himbert, F.
Application d’une stratégie de plans d’expérience lors d’une synthèse enzymatique
Cosmetosciences
févr. 2019 - Orléans.
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Bournez, C. ; Gally, J.-M. ; Do Q.T. ; Aci-Sèche, S. ; Bernard, P. ; Bonnet, P.
Identification d’ingrédients actifs naturels par criblage virtuel et validation expérimentale
Cosmetosciences
févr. 2019 - Orléans.
COMMUNICATIONS FLASHS DANS UN CONGRÈS NATIONAL
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Learning from MD simulations dataset
1st deep learning for sciences days (JDLS)
mai 2023 - Orsay.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Prediction of binding affinity of protein-ligand complexes combining molecular dynamics simulations with deep learning algorithms
Biotechnocentre
oct. 2021 - Les Hauts de Bruyères.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Protein-Ligand binding affinity prediction using combined molecular dynamics and deep learning approaches
XXII congrès du GGMM (Group of Graphism and Molecular Modeling) & 10èmes journées de la SFCi (French Society of Chemoinformatics )
oct. 2021 - Lille.
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Peyrat, G. ; Carles, F. ; Bourg, S. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
Perspective in data mining, data visualization and deep learning for kinase research
Prix du meilleur poster
9èmes Journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCI-2019
nov. 2019 - Paris.
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Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Gally, J.-M. ; Krezel, P. ; Driowya, M. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P.
Frags2Drugs: discovery of kinase inhibitors from a fragment network
9èmes Journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCI-2019
nov. 2019 - Paris.
COMMUNICATIONS FLASHS DANS UN CONGRÈS INTERNATIONAL
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Berabez, R. ; Champiré, A. ; Sainjon, M. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Mathea, S. ; Knapp, S. ; Cosson, A. ; Corret, J. ; Girardin, C. ; Ruchaud, S. ; Vallée, B. ; Brion, R. ; Verrecchia, F. ; Plé, K. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
Synthesis and preclinical validation of LIMKs inhibitors: Promising drugs for osteosarcoma treatment?
XXVII EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry (EFMC-ISMC 2022)
sept. 2022 - Nice.
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Libouban, P.-Y. ; Aci-Sèche, S. ; Tresadern, G. ; Bonnet, P.
Learning from molecular dynamics simulations with deep neural networks for the prediction of protein-ligand binding affinity
29th Young Research Fellow Meeting
juil. 2022 - Nantes.
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Pescheteau, C. ; Place, M. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Ruchaud, S. ; Buron, F. ; Routier, S.
Imidazo[2,1-b][1,3,4]thiadiazoles : Conception and synthesis of novel DYRK1A/CLK1 dual inhibitors
27th Young Research Fellow Meeting
janv. 2020 - Caen.