Équipements

L’équipe de Bioinformatique Structurale et Chémoinformatique est équipée de plusieurs stations de travail et de 2 clusters :

15 stations de travail

1 cluster CPU contenant:

6 noeuds Dell™ PowerEdge™ R410  bipro Hexa core (12 cpus) Intel(R) Xeon(R) CPU X5650 @ 2.67GHz

1 nœud: bipro Intel Xeon BroaddWell 14C E5-2680 v4 (28 cpus)

2 nœuds: bipro Intel Xeon Gold 6132 14C (28 cpus)

Plateforme d'imagerie quantitative - PIQ - Faculté de pharmacie - Université de Strasbourg

1 cluster de cartes GPU contenant:

1 noeud : bipro Hexa core (12 cpus), Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2630 v2 @ 2.60GHz; 2 cartes NVIDIA TESLA K20 + 2 cartes NVIDIA TESLA K80

2 nœuds: bipro Deca core (10 cpus), Intel Xeon Haswel Bridge 10 cœurs E5-2630 V4 @ 2.2Ghz; 4 cartes GPU GeForce GTX Titan-Z

4 nœuds: bipro Intel Gold 5115 10C (20 cpus); 8 cartes GPU GeForce RTX 2080

1 nœud: bipro Intel Gold 5215 10C (20 cpus); 2 cartes GPU GeForce RTX 3090

 

L’équipe a aussi accès à CaSciModOT (Calcul Scientifique et Modélisation Orléans Tours).

L’équipe utilise de nombreux logiciels commerciaux et académiques comme MOE (Chemical Computing Group), la suite Schrödinger, Gold (CCDC), la suite Openeye, Gaussian, NAMD et AMBER (UCSF).