Communications des 5 dernières années

Vous trouverez ici la liste des communications de l'équipe sur les 5 dernières années, pour avoir l'ensemble des données vous pouvez consulter la page des productions.

CONFÉRENCES

  1. Bonnet, P.
    Current trends in the design of kinase inhibitors
    Présentation IPSEN
    nov. 2014 - Les Ulis.

  2. Bonnet, P.
    Combining medicinal chemists expertise and in silico methods to discover novel kinase inhibitors
    27ème Colloque Biotechnocentre « Rencontres dans les domaines de la Santé, de la Biologie et du Bien-être en région Centre »
    oct. 2014 - Seillac.

  3. Bonnet, P.
    Integration of in silico tools for kinase drug discovery
    XXIIth Groupement des Pharmacochimistes de l’Arc Atlantique (GP2A)
    août 2014 - Nantes.

  4. Bonnet, P.
    Design of novel kinase inhibitors: a molecular informatics challenge
    Journées Scientifiques de l’École Doctorale MTCI
    avril 2014 - Paris.

  5. Bonnet, P.
    Design of novel kinase inhibitors using protein structural plasticity
    CCG MOE UGM & Conférence 2014 Europe
    avril 2014 - Strasbourg.

  6. Bonnet, P.
    L'identification d'inhibiteurs de protéines kinases, un défi
    Journées Scientifiques de l’École Doctorale MTCI, Site des Cordeliers
    avril 2014 - Paris.

  7. Bonnet, P.
    Importance of protein kinase plasticity in the design of novel inhibitors
    Séminaire externe CBM UPR CNRS 4301
    févr. 2014 - Orléans.

CONFÉRENCES INVITÉES DANS UN CONGRÈS INTERNATIONAL

  1. Bonnet, P.
    A Fast in Silico Fragment-Based Design Tool for the Discovery of Novel Kinase Inhibitors
    Annual One-Day Meeting on Medicinal Chemistry of SRC & KVCV
    nov. 2018 - Namur (Belgique).

  2. Buron, F. ; Rodrigues, N. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Ruchaud, S. ; Jourdan, M.-L. ; Marionneau-Lambot, S. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
    Conception d’inhibiteurs mixtes PI3k/mTOR : de la chimie a la maturation par la satt-grand centre
    Colloque Franco-Roumain de Chimie Appliquée (CoFrRoCA 2018)
    juil. 2018 - Bacău (Roumanie).

  3. Bonnet, P.
    In silico fragment-based design of kinase inhibitors
    26èmes Rencontres Internationales des Pharmacochimistes de l'Arc Atlantique et 32èmes Journées Franco-Belges de Chimie Thérapeutique (GP2A-JFB 2018)
    juin 2018 - Asnelles sur Mer.

  4. Bonnet, P.
    Challenges and successes in using in silico tools in kinase research
    Strasbourg Summer School in Chemoinformatics
    juin 2016 - Strasbourg.

  5. Bonnet, P.
    Shedding light on protein kinase plasticity
    51th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2015)
    juil. 2015 - Avignon.

CONFÉRENCES INVITÉES DANS UN CONGRÈS NATIONAL

  1. Bonnet, P.
    Conception et valorisation de chimiothèques comme sources de molécules bioactives
    Journée Thématique « Biodiversité et Innovations pour la Santé et le Bien-être» - Biotechnocentre
    juin 2017 - Olivet.

  2. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Binding kinetics prediction by molecular dynamics and transition state theory
    54ème édition de la SECO
    mai 2017 - Saint-Martin-de-Londres.

  3. Bonnet, P.
    Identification et validation de nouvelles cibles thérapeutiques contre l'arthrose (drugs4Arth)
    4ème Colloque Recherche CHRO
    janv. 2016 - Orléans.

COMMUNICATIONS ORALES

  1. Arora, R. ; Bonnet, P.
    Understanding protein plasticity to improve kinase inhibitor design
    Journée de la Fédération Physique et Chimie du Vivant
    juin 2014 - Orléans.

  2. Bonnet, P.
    La bioinformatique structurale et la chémoinformatique, des outils d'aide au développement de projets REpiCGO
    1ère Journée du Réseau Epigénétique du Cancéropôle Grand Ouest (REpiCGO)
    juin 2014 - Les Sables d'Olonne.

  3. Bonnet, P.
    La bioinformatique structurale et la chémoinformatique, des outils d'aide au développement de projets REpiCGO
    1ère Journée du Réseau Epigénétique du Cancéropôle Grand Ouest (REpiCGO)
    juin 2014 - Sables d'Olonne.

  4. Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Broad profiling prediction of protein kinase inhibitors via kinochemometrics approaches
    Colloque Chemical Biology
    juin 2014 - Paris.

  5. Buron, F. ; Saurat, T. ; Rodriguez, N. ; Guillaumet, G. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Rio, P. ; Jourdan, M.-L. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
    Design, synthesis, and biological activity of pyridopyrimidine scaffolds as novel PI3K/mTOR dual inhibitors
    Journée de la Fédération Physique et Chimie du Vivant
    juin 2014 - Orléans.

  6. Bonnet, P.
    L'identification d'inhibiteurs de protéines kinases, un défi
    Les Journées Scientifiques de l’École Doctorale MTCI, Site des Cordeliers
    avril 2014 - Paris.

  7. Bonnet, P.
    Design of novel kinase inhibitors using protein structural plasticity
    CCG User Group Meeting & Conference Europe
    avril 2014 - Strasbourg.

  8. Bonnet, P.
    Importance of protein kinase plasticity in the design of novel inhibitors
    Centre de Biologie Moléculaire (CBM)
    févr. 2014 - Orléans.

SÉMINAIRES INVITÉS INTERNATIONAL

  1. Bonnet, P.
    Current challenges in kinase research
    Présentation Genfit
    mars 2016 - Loos.

COMMUNICATIONS ORALES DANS UN CONGRÈS INTERNATIONAL

  1. Couly, F. ; Diharce, J. ; Bonnet, P. ; Meijer, L. ; Fruit, C. ; Besson, T.
    Conception of DYRK1A Kinase inhibitors via metal-catalyzed C–H arylation, inspired by fragment-growing studies
    4th International Electronic Conference on Medicinal Chemistry
    nov. 2018 - Internet.

  2. Aci-Sèche, S. ; Braka, A. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    In silico prediction of binding kinetics for protein-ligand complexes
    22nd European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships (EuroQSAR 2018)
    sept. 2018 - Thessalonique (Grèce).

  3. Bournez, C. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs : Discovery of new kinase inhibitors from 3D fragment network
    Chemoinformatics Strasbourg Summer School 2018
    juin 2018 - Strasbourg.

  4. Diharce, J. ; Bournez, C. ; Krezel, P. ; Fruit, C. ; Besson, T. ; Bonnet, P.
    Fragment-based drug design approach using a novel in silico tools to inhibit DYRK kinase family
    26èmes Rencontres Internationales des Pharmacochimistes de l'Arc Atlantique et 32èmes Journées Franco-Belges de Chimie Thérapeutique (GP2A-JFB 2018)
    juin 2018 - Asnelles sur Mer.

  5. Fogha, J. ; Diharce, J. ; Obled, A. ; Bonnet, P.
    Crystallization additives, not so useless in in-silico kinase research
    Prix meilleure communication orale
    26èmes Rencontres Internationales des Pharmacochimistes de l'Arc Atlantique et 32èmes Journées Franco-Belges de Chimie Thérapeutique (GP2A-JFB 2018)
    juin 2018 - Asnelles sur Mer.

  6. Bournez, C. ; Gally, J.-M. ; Krezel, P. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs, a novel in silico FBDD tool
    25th Young Research Fellow Meeting
    mars 2018 - Orléans.

  7. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Impact and prediction of binding kinetics on in vivo drug efficacy
    25th Young Research Fellow Meeting
    mars 2018 - Orléans.

  8. Gally, J.-M. ; Heinrich, J. T. ; Obled, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs: a novel in silico tool for Fragment-Based Drug Discovery
    XXIVème Journées Jeunes Chercheurs (SCT)
    févr. 2017 - Châtenay-Malabry.

  9. Place, M. ; Elie, J. ; Carles, F. ; Baratte, B. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
    Design of novel imidazopyridazines as strong Haspin inhibitors
    XXIVème Journées Jeunes Chercheurs (SCT)
    févr. 2017 - Châtenay-Malabry.

  10. Gally, J.-M. ; Heinrich, J. T. ; Obled, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs: a novel in silico tool for Fragment-Based Drug Discovery
    30èmes Journées Franco-Belges de Pharmacochimie (JFB2016)
    mai 2016 - Amboise.

  11. Gally, J.-M. ; Heinrich, J. T. ; Obled, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs: a novel in silico tool for Fragment-Based Lead Discovery
    30èmes Journées Franco-Belges de Pharmacochimie (JFB2016)
    mai 2016 - Amboise.

COMMUNICATIONS ORALES DANS UN CONGRÈS NATIONAL

  1. Bournez, C. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Driowya, M. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P.
    D’un réseau de fragments 3D à la conception de nouveaux inhibiteurs de kinases
    30ème colloque Biotechnocentre
    oct. 2018 - Seillac.

  2. Bournez, C. ; Gally, J.-M. ; Krezel, P. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs, a novel in silico FBDD tool
    17èmes REncontres en Chimie Organique Biologique (RECOB17)
    mars 2018 - Aussois.

  3. Canault, B. ; Bourg, S. ; Vayer, P. ; Bonnet, P.
    Metapredict : une plate-forme in silico de prédiction ADME-tox
    Prix de la communication orale
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  4. Place, M. ; Elie, J. ; Carles, F. ; Baratte, B. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
    Développement d'inhibiteurs sélectifs d'Haspin de type imidazopyridazines
    13ème colloque de l'Axe Valorisation des produits de la mer en cancérologie et 4ème colloque du Réseau Canaux ioniques et cancer
    mai 2017 - Mansigné.

  5. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Simulations des chemins d’association ligand-protéine pour la prédiction des constantes de cinétique
    Prix communication orale
    Journées de la Section Régionale Centre Ouest de la SCF
    févr. 2017 - Tours.

  6. Bonnet, P.
    Chimiothèques & Chimiothèque Nationale
    Ecole Thématique de Criblage 2016
    sept. 2016 - Autrans.

  7. Bonnet, P.
    Chimiothèque Nationale
    10èmes journées du Cancéropôle Grand Ouest
    juin 2016 - Sables d'Olonne.

  8. Aci-Sèche, S.
    Structural bioinformatics and chemoinformatics for kinase drug discovery
    23ème journée du projet CASCIMODOT
    déc. 2015 - Orléans.

  9. Gally, J.-M. ; Bosc, N. ; Pihan, E. ; Canault, B. ; Arora, R. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    A freely accessible workflow for the preparation of molecules for virtual screening
    7èmes journées de la Société Française de Chemoinformatique (SFCI 2015)
    oct. 2015 - Nice.

  10. Bosc, N. ; Wroblowski, B. ; Aci-Sèche, S. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    A Proteometric analysis of human kinome: insight into discriminant conformation-dependent residues
    Groupe de Graphisme et de Modélisation Moléculaire (GGMM)
    mai 2015 - Sète.

  11. Castaing, B. ; Goffinont, S. ; Coste, F. ; Culard, F. ; Rieux, C. ; Garnier, N. ; Bourg, S. ; Bonnet, P.
    Inhibition selective des ADN glycosylases : approaches structure-fonction
    4ème congrès du Groupe Thématique Enzymes et 19ème congrés du Groupe Graphisme et Modélisation
    mai 2015 - Sète.

  12. Golib-Dzib, J.-F. ; Arora, R. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    A study on the classification of protein kinase conformations: a 1-2-3 rule
    The FdV PhD Retreat 2015
    mai 2015 - Carry-le-Rouet.

COMMUNICATIONS PAR POSTER

  1. Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Broad profiling prediction of protein kinase inhibitors via kinochemometrics approaches
    27ème Colloque Biotechnocentre
    oct. 2014 - Seillac.

  2. Gally, J.-M. ; Bosc, N. ; Pihan, E. ; Arora, R. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Canault, B. ; Bonnet, P.
    A free accessible workflow for preprocessing virtual screening experiments
    27ème Colloque Biotechnocentre
    oct. 2014 - Seillac.

  3. Buron, F. ; Saurat, T. ; Rodriguez, N. ; Guillaumet, G. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Rio, P. ; Jourdan, M.-L. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
    Synthesis and biological evaluation of new pyridopyrimidines compounds as dual PI3K/mTOR inhibitors
    Symposium de Chimie Organique en Centre-Auvergne-Limousin (SyCOCAL IX)
    sept. 2014 - Tours.

  4. Elie, J. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
    Synthesis of imidazo[1,2-b]pyridazines derivatives as Haspin inhibitors
    Symposium de Chimie Organique en Centre-Auvergne-Limousin (SyCOCAL IX)
    sept. 2014 - Tours.

  5. Arora, R. ; Brehmer, D. ; Jacoby, E. ; Bonnet, P.
    Understanding protein plasticity to improve kinase inhibitor design
    50th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2014)
    juil. 2014 - Rouen.

  6. Buron, F. ; Saurat, T. ; Rodriguez, N. ; Guillaumet, G. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Rio, P. ; Jourdan, M.-L. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
    Design, synthesis, and biological activity of pyridopyrimidine scaffolds as novel PI3K/mTOR dual inhibitors
    50th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2014)
    juil. 2014 - Rouen.

  7. Elie, J. ; Buron, F. ; Baratte, B. ; Ruchaud, S. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Routier, S.
    Synthesis of Imidazo[1,2-b]Pyridazines derivatives as haspin inhibitors
    50th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2014)
    juil. 2014 - Rouen.

  8. Khater, S. ; Golib, F. ; Bonnet, P. ; West, C.
    Chemoinformatics strategies to probe chiral chromatography
    CHIRALITY 2014 (26th International Symposium on Chiral Discrimination, ISCD-26)
    juil. 2014 - Prague (République Tchèque).

  9. Pihan, E. ; Canault, B. ; Arora, R. ; Golib-Dzib, J.-F. ; Bosc, N. ; Bourg, S. ; Bonnet, P.
    Large scale kinase virtual screening plateform
    50th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2014)
    juil. 2014 - Rouen.

  10. Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Broad profiling prediction of protein kinase inhibitors via kinochemometrics approaches
    Colloque Chemical Biology
    juin 2014 - Paris.

  11. Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Broad profiling prediction of protein kinase inhibitors via kinochemometrics approaches
    Chemoinformatics Strasbourg Summer School (CS3)
    juin 2014 - Strasbourg.

  12. Cadix, M. ; Golib-Dzib, J.-F. ; Bonnet, P.
    Etude de données RNA-seq appliquée à la médecine personnalisée
    Journée scientifique de la Fédération de Recherche FR2708
    juin 2014 - Orléans.

  13. Gally, J.-M. ; Bosc, N. ; Pihan, E. ; Arora, R. ; Bourg, S. ; Canault, B. ; Bonnet, P.
    Development of a universal workflow for the preparation of molecular databases for virtual screening
    Journée scientifique de la Fédération de Recherche FR2708
    juin 2014 - Orléans.

  14. Gally, J.-M. ; Bosc, N. ; Pihan, E. ; Arora, R. ; Bourg, S. ; Canault, B. ; Bonnet, P.
    Development of a universal workflow for the preparation of molecular databases for virtual screening
    prix du public
    Chemoinformatics Strasbourg Summer School (CS3)
    juin 2014 - Strasbourg.

COMMUNICATIONS PAR POSTER DANS UN CONGRÈS INTERNATIONAL

  1. Carles, F. ; Bourg, S. ; Peyrat, G. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Future perspective in data mining, data visualization and deep learning for kinase research
    22nd European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships (EuroQSAR 2018)
    sept. 2018 - Thessalonique (Grèce).

  2. Raimbault, A. ; Anh Ma, C. M. ; Bonnet, P. ; Ferri, M. ; Lämmerhofer, M. ; West, C.
    Quinine-based zwitterionic stationary phases: exploring retention and enantioseparation mechanisms in supercritical fluid chromatography
    32nd International Symposium on Chromatography (ISC 2018)
    sept. 2018 - Cannes-Mandelieu.

  3. Bournez, C. ; Gally, J.-M. ; Krezel, P. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs: A 3D fragment network to discover new compounds
    256th ACS National Meeting
    août 2018 - Boston (USA).

  4. Buron, F. ; Place, M. ; Elie, J. ; Carles, F. ; Feizbakhsh, O. ; Baratte, B. ; Ruchaud, S. ; Bonnet, P. ; Routier, S.
    Synthesis and biological evaluation of imidazopyridazine derivatives as strong haspin inhibitors
    54èmes Rencontres Internationales de Chimie Thérapeutique (RICT 2018)
    juil. 2018 - Strasbourg.

  5. Driowya, M. ; Allouchi, H. ; Gally, J.-M. ; Bonnet, P. ; Guillaumet, G.
    Synthesis of novel series of 7,7?-(substituted methylene)bis-imidazo[1,2-b]pyrazoles and imidazo[1,2-a]imidazoles via an acid catalyzed one-pot three-component reaction
    16th Belgian Organic Synthesis Symposium (BOSS)
    juil. 2018 - Bruxelles (Belgique).

  6. Bournez, C. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs : Finding new kinase inhibitors from graph-based fragments linking approach
    26èmes Rencontres Internationales des Pharmacochimistes de l'Arc Atlantique et 32èmes Journées Franco-Belges de Chimie Thérapeutique (GP2A-JFB 2018)
    juin 2018 - Asnelles sur Mer.

  7. Couly, F. ; Diharce, J. ; Bonnet, P. ; Chaikuad, A. ; Knapp, S. ; Bhansali, R. ; Rammohan, M. ; Crispino, J. ; Lindberg, M. ; Meijer, L. ; Fruit, C. ; Besson, T.
    Promising DYRK1A inhibitor synthesized by late-stage C-H arylation
    26èmes Rencontres Internationales des Pharmacochimistes de l'Arc Atlantique et 32èmes Journées Franco-Belges de Chimie Thérapeutique (GP2A-JFB 2018)
    juin 2018 - Asnelles sur Mer.

  8. Driowya, M. ; Allouchi, H. ; Gally, J.-M. ; Bonnet, P. ; Guillaumet, G.
    Synthesis of novel series of 7,7?-(substituted methylene)bis-imidazo[1,2-b]pyrazoles and imidazo[1,2-a]imidazoles via an acid catalyzed one-pot three-component reaction
    17th meeting of the French-American Chemical Society (FACS XVII )
    juin 2018 - Orléans.

  9. Carles, F. ; Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Proteochemometrics : Combining 3D structural data and deep learning for predicting kinase-ligand interactions
    25th Young Research Fellow Meeting
    mars 2018 - Orléans.

  10. Diharce, J. ; Cueto, M. ; Aucagne, V. ; Beltramo, M. ; Bonnet, P.
    Peptide-derived fragment covalent docking: an in silico tools for peptide-protein interaction
    25th Young Research Fellow Meeting
    mars 2018 - Orléans.

  11. Fogha, J. ; Diharce, J. ; Routier, S. ; Cartron, P. F. ; Bonnet, P.
    Computational investigation of DNMT1 and p53 interaction
    25th Young Research Fellow Meeting
    mars 2018 - Orléans.

  12. Bourg, S. ; Place, M. ; Copin, C. ; Chaikuad, A. ; Ruchaud, S. ; Knapp, S. ; Buron, F. ; Routier, S. ; Bonnet, P.
    In silico fragment-based ligand design to identify novel CLK1 inhibitors
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  13. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Kinetic rates prediction of protein kinase inhibitors by enhanced molecular dynamics
    K4DD Meeting - Binding kinetics: Time is of the essence
    oct. 2017 - Berlin (Germany).

  14. Carles, F. ; Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    2.5D Proteochemometrics: A tool to predict protein kinase-ligand activities
    6th RDKit UGM 2017
    sept. 2017 - Berlin (Germany).

  15. Gally, J.-M. ; Bourg, S. ; Do Q.T. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    VSPrep : A General KNIME Workflow for the Preparation of Molecules for Virtual Screening
    6th RDKit UGM 2017
    sept. 2017 - Berlin (Germany).

  16. Champiré, A. ; Braka, A. ; Vallée, B. ; Doudeau, M. ; Godin, F. ; Plé, K. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Cubéros, H. ; Marouillat, S. ; Thepault, R.-A. ; Vour’ch, P. ; Andrès, C. ; Castelnau, P. ; Bonnet, P. ; Routier, S. ; Bénédetti, H.
    LIM kinases as new therapeutic targets for the treatment of neurofibromatosis type 1
    VII International Symposium on Advances in Synthetic and Medicinal Chemistry (EFMC)
    août 2017 - Vienne (Autriche).

  17. Place, M. ; Buron, F. ; Carles, F. ; Elie, J. ; Feizbakhsh, O. ; Baratte, B. ; Bonnet, P. ; Ruchaud, S. ; Routier, S.
    Design of novel imidazopyridazines as strong haspin inhibitors
    Prix pour la meilleure présentation poster
    4th EFMC Young Medicinal Chemist Symposium
    août 2017 - Vienne (Autriche).

  18. Bourg, S. ; Place, M. ; Copin, C. ; Chaikuad, A. ; Ruchaud, S. ; Knapp, S. ; Buron, F. ; Routier, S. ; Bonnet, P.
    Identification of novel CLK1 inhibitors from in silico fragment-based ligand design
    Rencontres internationales de chimie thérapeutique (RICT)
    juil. 2017 - Toulouse.

  19. Buron, F. ; Place, M. ; Elie, J. ; Feizbakhsh, O. ; Carles, F. ; Baratte, B. ; Bonnet, P. ; Ruchaud, S. ; Routier, S.
    Synthesis and biological evaluation of novel imidazopyridazines as strong haspin inhibitors synthesis
    Rencontres internationales de chimie thérapeutique (RICT)
    juil. 2017 - Toulouse.

  20. Oyallon, B. ; Brachet, M. ; Bonnet, P. ; Baratte, B. ; Robert, T. ; Ruchaud, S. ; Bach, S. ; Berthelot, P. ; Gouilleux, F. ; Viaud-Massuard, M. C. ; Denevault-Sabourin, C.
    Design and synthesis of novel quinoxaline-2-carboxylic acids and analogues as PIM-1 inhibitors
    Rencontres internationales de chimie thérapeutique (RICT)
    juil. 2017 - Toulouse.

  21. Rodrigues, N. ; Buron, F. ; Saurat, T. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Jourdan, M.-L. ; Ruchaud, S. ; Marionneau-Lambot, S. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
    Conception, synthesis and biological evaluation of new pyridopyrimidines as PI3K/mTOR dual inhibitors
    Rencontres internationales de chimie thérapeutique (RICT)
    juil. 2017 - Toulouse.

  22. Sirbu, D. ; Martinić, I. ; Eliseeva, S. ; Petoud, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P. ; Suzenet, F.
    Compact amphiphilic fluorescent probes: From discovery to application in cell imaging
    Rencontres internationales de chimie thérapeutique (RICT)
    juil. 2017 - Toulouse.

  23. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Binding kinetics prediction by molecular dynamics and transition state theory
    8th International Theoretical Biophysics Symposium (THEOBIO 2017)
    juin 2017 - Saint-Sébastien (Espagne).

  24. Jablonsky, M. J. ; Kalinowska-Tluscik, J. ; Bonnet, P. ; Satala, G. ; Mordalski , S. ; Bojarski, A. J.
    Structural features for ligand recognition in selected 5-HT receptors
    50th Course ERICE Integrative Structural Biology
    juin 2017 - Erice (Italy).

  25. Champiré, A. ; Braka, A. ; Vallée, B. ; Doudeau, M. ; Godin, F. ; Plé, K. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Cubéros, H. ; Marouillat, S. ; Thepault, R.-A. ; Vour’ch, P. ; Andrès, C. ; Castelnau, P. ; Bonnet, P. ; Routier, S. ; Bénédetti, H.
    Design, synthesis and biological evaluation of LIMK inhibitors
    Journée Jeunes Chercheurs SCT
    févr. 2017 - Châtenay-Malabry.

  26. Sirbu, D. ; Martinić, I. ; Eliseeva, S. ; Petoud, S. ; Bonnet, P. ; Guillaumet, G. ; Suzenet, F.
    Outstanding amphiphilic high-fluoresc ent probes: from the discovery to their application in cell imaging
    PSL* Chemical Biology Symposium
    déc. 2016 - Paris.

  27. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Computational study of ligand-receptor binding process using enhanced molecular dynamics simulations
    21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship
    sept. 2016 - Verona (Italy).

  28. Canault, B. ; Bourg, S. ; Vayer, P. ; Bonnet, P.
    METAPREDICT: an in silico platform for ADME-Tox prediction
    21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship - EuroQSAR
    sept. 2016 - Verona (Italy).

  29. Place, M. ; Copin, C. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
    Design of disubstituted imidazo[2,1-b][1,3,4]thiadiazoles as novel DYRK1A/CLK1 dual inhibitors
    Journée de Chimie Organique (JCO)
    sept. 2016 - Palaiseau.

  30. Place, M. ; Copin, C. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Buron, F. ; Routier, S.
    Design of imidazo[2,1-b][1,3,4]thiadiazoles deriatives as DYRK1A/CLK1 dual inhibitors
    6th EuCheMS Chemistry Congress
    sept. 2016 - Seville (Espagne).

  31. Vallée, B. ; Doudeau, M. ; Godin, F. ; Champiré, A. ; Plé, K. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Cubéros, H. ; Marouillat, S. ; Thepault, R.-A. ; Vour’ch, P. ; Andrès, C. ; Castelnau, P. ; Bonnet, P. ; Routier, S. ; Bénédetti, H.
    LIM kinases: new therapeutic targets to treat Neurofibromatosis type I
    7th EMBO Meeting
    sept. 2016 - Mannheim (Germany).

  32. Aci-Sèche, S. ; Arora, R. ; Linders, J. T. M. ; Verheijen, T. ; Van Heerde, E. ; Chaikuad, A. ; Brehmer, D. ; Knapp, S. ; Bonnet, P.
    Identification of a novel type II B-Raf paradox breaker inhibitor
    52èmes Rencontre Internationales de Chimie Thérapeutiques (RICT 2016)
    juil. 2016 - Caen.

  33. Buron, F. ; Place, M. ; Copin, C. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Routier, S.
    Design of Imidazo[2,1-b][1,3,4]thiadiazoles derivatives as novel DYRK1A/CLK1 dual inhibitors
    52th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2016)
    juil. 2016 - Caen.

  34. Buron, F. ; Rodriguez, N. ; Jourdan, M.-L. ; Marionneau-Lambot, S. ; Ruchaud, S. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
    Design, optimization and in-vivo evaluation of new pyridopyrimidines as PI3K/mTOR dual inhibitors
    52th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2016)
    juil. 2016 - Caen.

  35. Gally, J.-M. ; Heinrich, J. T. ; Obled, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs: identification of kinase inhibitors using a novel in silico FBLD tool
    Seventh Joint Sheffield Conference on Chemoinformatics (MGMS 2016)
    juil. 2016 - Sheffield (England).

  36. Carles, F. ; Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Prediction of protein kinase-ligand interactions through 2.5D Proteochemometrics
    Chemoinformatics Strasbourg Summer School 2016
    juin 2016 - Strasbourg.

  37. Canault, B. ; Gally, J.-M. ; Braka, A. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Evaluation of rDock docking tool for kinase drug discovery
    Journée Jeunes Chercheurs SCT
    févr. 2016 - Lille.

  38. Bonnet, P. ; Bosc, N. ; Wroblowski, B. ; Aci-Sèche, S. ; Meyer, C.
    Proteometrics, chemometrics and proteochemometrics: helpful tools for kinase drug discovery
    FMC 2015 - Frontiers in Medicinal Chemistry
    sept. 2015 - Antwerp (Belgium).

  39. Bosc, N. ; Bonnet, P.
    The use of various selectivity scores in kinase research
    51th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2015)
    juil. 2015 - Avignon.

  40. Bourg, S. ; Pihan, E. ; Canault, B. ; Arora, R. ; Golib, F. ; Gally, J.-M. ; Bosc, N. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    In silico kinase platform (ISKP): a tool for the identification of selective kinase inhibitors
    51th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2015)
    juil. 2015 - Avignon.

  41. Buron, F. ; Rodriguez, N. ; Saurat, T. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Rio, P. ; Jourdan, M.-L. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
    Design and synthesis of dual PI3K/mTOR in the treatment of breast cancer
    51th International Conference on Medicinal Chemistry (RICT 2015)
    juil. 2015 - Avignon.

  42. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Towards the development of an in silico tools for kinetics
    2nd Nov AliX Conference Biophysics in Drug Discovery 2015
    juin 2015 - Strasbourg.

  43. Duval, J. ; Colas, C. ; Bonnet, P. ; Pecher, V. ; Poujol, M. ; Tranchant, J.F. ; Lesellier, E.
    Développement du couplage SFC-APCI-HRMS. Application à la caractérisation phytochimique d'extraits de graines de Kniphofia Uvaria
    Congrès de l’Association Francophone des Sciences Séparatives (SEP 2015)
    avril 2015 - Paris.

  44. Stephany, O. ; Tisse, S. ; Cardinael, P. ; Khater, S. ; Bonnet, P. ; West, C.
    Caractérisation de phases stationnaires originales pour la résolution d’énantiomères par chromatographie en phase gazeuse
    Congrès de l’Association Francophone des Sciences Séparatives (SEP 2015)
    avril 2015 - Paris.

  45. Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Proteometrics, chemometrics and proteochemometrics: helpful tools for kinase drug discovery
    22nd Young Research Fellows Meeting
    févr. 2015 - Paris.

COMMUNICATIONS PAR POSTER DANS UN CONGRÈS NATIONAL

  1. Peyrat, G. ; Bournez, C. ; Krezel, P. ; Gally, J.-M. ; Driowya, M. ; Aci-Sèche, S. ; Guillaumet, G. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs: a novel in silico Fragment Based Drug Design tool
    30ème colloque Biotechnocentre
    oct. 2018 - Seillac.

  2. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    LIM kinase inhibitor discovery by flexible protein high-throughput virtual screening
    Journée Fédération de Recherche Physique et Chimie du Vivant – FR2708
    janv. 2018 - Orléans.

  3. Carles, F. ; Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Deep learning in proteochemometrics
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  4. Diharce, J. ; Cueto, M. ; Aucagne, V. ; Beltramo, M. ; Bonnet, P.
    Prediction of peptide-protein interactions with a novel in silico tool
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  5. Fogha, J. ; Diharce, J. ; Routier, S. ; Cartron, P. F. ; Bonnet, P.
    Computational Investigation of DNMT1 and P53 Interaction
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  6. Gally, J.-M. ; Bourg, S. ; Do Q.T. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    VSPrep : A General KNIME Workflow for the Preparation of Molecules for Virtual Screening
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  7. Ziada, S. ; Aci-Sèche, S. ; Raimbaud, E. ; Ducrot, P. ; Bonnet, P.
    Prediction of kinetic binding constants using biased MD simulations
    Prix poster SFCi
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  8. Fogha, J. ; Diharce, J. ; Routier, S. ; Cartron, P. F. ; Bonnet, P.
    Structural Insights into the Binding of DNMTs to P53
    Groupe de Graphisme et Modélisation Moléculaire - GGMM 2017
    mai 2017 - Reims.

  9. Gally, J.-M. ; Bourg, S. ; Do Q.T. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    VSPrep: a freely accessible workflow for the preparation of molecules for virtual screening
    20ème congrès du Groupe Graphisme et Modélisation Moléculaire - GGMM 2017
    mai 2017 - Reims.

  10. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Path-based simulation of ligand-receptor binding process for binding kinetics prediction
    XXIVème Journées Jeunes Chercheurs (SCT)
    févr. 2017 - Châtenay-Malabry.

  11. Fogha, J. ; Diharce, J. ; Routier, S. ; Cartron, P. F. ; Bonnet, P.
    Structural Insights into the Binding of DNMTs to P53
    EpiBrest 2016
    déc. 2016 - Brest.

  12. Diharce, J. ; Cueto, M. ; Aucagne, V. ; Beltramo, M. ; Bonnet, P.
    A novel in silico tool for the prediction of peptide-GPCR interactions
    Prix poster du congrès, section Post-doctorant
    5th Annual Meeting of the GDR 3545 G-protein Coupled Receptors, from physiology to Drugs
    nov. 2016 - Tours.

  13. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Etude par simulations de dynamique moléculaire de la cinetique du processus d'association récepteur-ligand
    29ème Colloque Biotechnocentre
    oct. 2016 - Seillac.

  14. Carles, F. ; Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Machine learning and data mining in kinase drug discovery
    29ème Colloque Biotechnocentre
    oct. 2016 - Seillac.

  15. Champiré, A. ; Braka, A. ; Vallée, B. ; Doudeau, M. ; Godin, F. ; Plé, K. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Cubéros, H. ; Marouillat, S. ; Thepault, R.-A. ; Vour’ch, P. ; Andrès, C. ; Castelnau, P. ; Bonnet, P. ; Routier, S. ; Bénédetti, H.
    Conception, synthèse et évaluation biologique d’inhibiteurs de LIM kinases
    Biotechnocentre
    oct. 2016 - Seillac.

  16. Gally, J.-M. ; Heinrich, J. T. ; Obled, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs: A new tool to design new kinase inhibitors from fragments
    Prix de la meilleure affiche
    29ème Colloque Biotechnocentre
    oct. 2016 - Seillac.

  17. Sirbu, D. ; Martinić, I. ; Eliseeva, S. ; Petoud, S. ; Bonnet, P. ; Guillaumet, G. ; Suzenet, F.
    Discovery of new amphiphilic and high-fluorescent probes: synthesis and application in cell-imaging
    Journée de Chimie Organique (JCO)
    sept. 2016 - Palaiseau.

  18. Rodrigues, N. ; Buron, F. ; Jourdan, M.-L. ; Marionneau-Lambot, S. ; Ruchaud, S. ; Bourg, S. ; Bonnet, P. ; Bénédetti, H. ; Routier, S.
    Conception d'inhibiteurs doubles PI3K/mTOR: de la synthèse à la maturation par la SATT Grand-Centre
    10èmes journées du Cancéropôle Grand Ouest
    juin 2016 - Sables d'Olonne.

  19. Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Bourg, S. ; Braka, A. ; Canault, B. ; Carles, F. ; Diharce, J. ; Fogha, J. ; Gally, J.-M. ; Lesellier, E. ; West, C. ; Ziada, S.
    Current Development of in silico tools for Drug Discovery
    Journée Fédération de Recherche Physique et Chimie du Vivant – FR2708
    janv. 2016 - Orléans.

  20. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Champiré, A. ; Bourg, S. ; Vallée, B. ; Bénédetti, H. ; Plé, K. ; Routier, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Structure-based design of LIM kinase inhibitors
    Journée Fédération de Recherche Physique et Chimie du Vivant – FR2708
    janv. 2016 - Orléans.

  21. Carles, F. ; Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Proteometrics, chemometrics and proteochemometrics: helpful tools for kinase drug discovery
    Journée Fédération de Recherche Physique et Chimie du Vivant – FR2708
    janv. 2016 - Orléans.

  22. Gally, J.-M. ; Bosc, N. ; Pihan, E. ; Canault, B. ; Arora, R. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    A freely accessible and automated workflow for the preparation of molecules for virtual screening
    Journée Fédération de Recherche Physique et Chimie du Vivant – FR2708
    janv. 2016 - Orléans.

  23. Vallée, B. ; Doudeau, M. ; Godin, F. ; Cubéros, H. ; Bénédetti, H. ; Champiré, A. ; Plé, K. ; Routier, S. ; Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P. ; Marouillat, S. ; Thepault, R. ; Vour’ch, P. ; Andrès, C. ; Castelnau, P.
    LIMK protein inhibitors, new therapeutic agents for treatment of cognitive disorders associated with type I Neurofibromatosis
    Journée Fédération de Recherche Physique et Chimie du Vivant – FR2708
    janv. 2016 - Orléans.

  24. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Toward the prediction of affinity and kinetics of protein kinase inhibitors
    Algorithms in Structural Bioinformatics winter-school: Sampling in Biomacromolecular Systems
    déc. 2015 - Cargèse.

  25. Aci-Sèche, S. ; Braka, A. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Toward the prediction of affinity and kinetics of protein kinase inhibitors
    7èmes journées de la Société Française de Chemoinformatique (SFCI 2015)
    oct. 2015 - Nice.

  26. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Binding kinetics prediction in virtual screening
    Prix poster
    28ème Colloque Biotechnocentre
    oct. 2015 - Seillac.

  27. Canault, B. ; Bourg, S. ; Vayer, P. ; Bonnet, P.
    Network map of integrated ADME-Tox databases
    Journées nationales de la Société Française de Chémoinformatique (SFCI)
    oct. 2015 - Nice.

  28. Sirbu, D. ; Cristofaro, E. ; Bonnet, P. ; Guillaumet, G. ; Suzenet, F.
    Newly developed amphiphilic fluorescent probes for molecular imaging
    Colloque Biotechnocentre
    oct. 2015 - Seillac.

  29. Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P. ; Bosc, N. ; Bourg, S. ; Braka, A. ; Canault, B. ; Cristofaro, E. ; Fogha, J. ; Gally, J.-M. ; Morin-Allory, L. ; Lesellier, E. ; Obled, A. ; West, C. ; Ziada, S.
    Group of Structural Bioinformatics & Chemoinformatics
    1st ICOA symposium
    juin 2015 - Orléans.

  30. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Towards the development of an in silico tools for kinetics
    Groupe de Graphisme et de Modélisation Moléculaire (GGMM)
    mai 2015 - Sète.

  31. Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Proteometrics, chemometrics and proteochemometrics: helpful tools for kinase drug discovery
    Journée Jeunes Chercheurs de la Section Régionale Centre-Ouest Société Chimique de France
    févr. 2015 - Orléans.

  32. Braka, A. ; Aci-Sèche, S. ; Bourg, S. ; Garnier, N. ; Bonnet, P.
    Kinetic prediction in flexible ligand-protein docking
    Journées de la Section Régionale Centre-Ouest de la SCF
    févr. 2015 - Orléans.

  33. Gally, J.-M. ; Bosc, N. ; Pihan, E. ; Arora, R. ; Canault, B. ; Bourg, S. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Combining the strengths of freely accessible toolkits: a universal workflow for the preparation of molecules for virtual screening
    Journées de la Section Régionale Centre Ouest de la SCF
    févr. 2015 - Orléans.

COMMUNICATIONS FLASHS DANS UN CONGRÈS NATIONAL

  1. Carles, F. ; Bosc, N. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Deep learning in proteochemometrics
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  2. Diharce, J. ; Cueto, M. ; Aucagne, V. ; Beltramo, M. ; Bonnet, P.
    Prediction of peptide-protein interactions with a novel in silico tool
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  3. Gally, J.-M. ; Bourg, S. ; Do Q.T. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    VSPrep : A General KNIME Workflow for the Preparation of Molecules for Virtual Screening
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

  4. Ziada, S. ; Aci-Sèche, S. ; Raimbaud, E. ; Ducrot, P. ; Bonnet, P.
    Prediction of kinetic binding constants using biased MD simulations
    Prix poster SFCi
    8es journées de la Société Française de Chémoinformatique - SFCi2017
    oct. 2017 - Orléans.

COMMUNICATIONS FLASHS DANS UN CONGRÈS INTERNATIONAL

  1. Carles, F. ; Bourg, S. ; Peyrat, G. ; Meyer, C. ; Bonnet, P.
    Future perspective in data mining, data visualization and deep learning for kinase research
    22nd European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships (EuroQSAR 2018)
    sept. 2018 - Thessalonique (Grèce).

  2. Bournez, C. ; Gally, J.-M. ; Krezel, P. ; Aci-Sèche, S. ; Bonnet, P.
    Frags2Drugs: A 3D fragment network to discover new compounds
    256th ACS National Meeting
    août 2018 - Boston (USA).